大長今

第31集
時間過了兩年，姜德久準備啟程到濟州去看長今。長今專研醫術已經稍有成就，隨時可以獨自幫病患把脈開立藥方，但是因為曾經幫張德施針出過很大的差錯，因此對於施針遲遲不敢再度嘗試。姜德久因為暈船嚴重，被人背到官衙藥局，長今以熏療法治療德久，德久終於漸漸甦醒，德久與長今兩人久別重逢，感慨萬千。當閔政浩與張德離開濟州到牛導去的時候，倭寇突襲濟州。倭寇主將生病急需大夫診療，長今被逼上陣施針，終於成功治癒倭將並且協助閔政浩擊退倭寇。

第32集
濟州牧使呈給皇上的奏摺內容謊稱長今內通倭寇。因此，長今被義禁府的官員押送到京城受到義禁府官員的拷問，幸好閔政浩挺身而出說出真相，長今才得以脫離險境。當長今知道閔政浩不願意留在京城，想要再度回到濟州去，長今勸閔政浩要留在宮內擔任京官職務為國效力。長今在回濟州的途中，到埋葬韓尚宮娘娘的地方拜別韓尚宮。因緣際會遇到一戶官宦子弟，並且替他根治久年不愈的陳疾。得知宮廷即將舉行醫女選拔，立刻趕回宮去參加選拔，鄭雲白為當時主考官之一，希望長今捨棄仇恨之心，以仁心仁術行醫。姜德久得知長今高中金榜，欣喜若狂，長今也正式入宮接受醫女訓練。

第33集
長今正式開始接受醫女教育訓練，遇到一位嚴厲的醫學教授。對於長今在途中幫一位戶判大人的公子治病事情相當不滿，因此還沒開始正式上課，就被教授視為眼中釘。 此後教授更是處處難為長今，雖然長今表現優異，不過申教授對於長今始終不假辭色， 申教授的考試等級分為五等，如果得到三個不通就會被淘汰，（在不是醫女時就私自替病患治療；過度分清毒藥與草藥的性能）因此長今已經被申教授記了兩個不通，萬一這次的考試再不通就必須要被淘汰。

第34集
長今與信非相互激勵，努力學習，成為醫女訓練班的最優秀學生。雖然長今承認自己過於傲慢，可還是得不到申教授的認可。張德元從濟州來看長今，長今喜出望外，同時鄭雲白也帶來一個壞訊息：告知長今已經得到三個不通，不能留在宮廷做醫女。原來是李教授公報私仇讓所有的醫女去做一天的官妓，故意刁難長今和信非，如果不照做就會被遣返鄉。申教授雖然據理力爭，卻被李教授威脅(因為當年申教授誤診導致皇上的愛臣病死)，在萬不得已之下，申教授決定讓所有的醫女訓練生都不通。惹惱了督提調。督提調決定親自來檢定這批醫女，意外發現長今信非等人非常的傑出。長今終於如願以償進入內醫院做醫女，開始嶄新的宮廷生活。

第35集
皇后娘娘突然有流產跡象，內醫院召集所有相關人員開緊急會議，此時御膳廚房最高尚宮也進入內醫院開會，長今和今英終於相遇。竟然在這樣的場合併以不同的身份相見，兩人難免震驚。當崔尚宮見到長今回到宮廷來，也忍不住驚訝與憤怒。內醫正鄭允壽居心不良，並且答應崔尚宮儘快想辦法將長今逐出宮廷。皇后娘娘身體一直沒有好轉，長今雖然對於內醫院第一醫女阿烈的診脈持有不同的意見，但是只能在心中存疑不敢明說。

第36集
皇后娘娘自從小產之後，身體一直無法恢復健康。內醫院諸位醫官以及醫女甚為憂心，卻又苦無其它辦法。此時，信非將長今與阿烈的診脈結果並不相同的事實告知申主簿，申主簿大為驚訝，認為此事非同小可。內醫院緊急開會並且決定由長今和阿烈重新再來診斷一次，阿烈認為皇后娘娘的脈象是牢脈，而長今則是把出散脈。散脈意謂著皇后娘娘的腹中還有死胎，但是大家分明親眼見到皇后娘娘已經產出死胎，萬一娘娘腹中真有死胎，除非娘娘懷的是雙胞胎，但是皇室內從未有過雙胞胎前例，但是鄭雲白相信長今為皇后所把的脈，並且決定使用佛手散芎歸湯。皇后娘娘終於產出另一個死胎，恢復健康。眾人也對長今的醫術另眼相看。但因此長今在宮廷里又多了一位勁敵阿烈醫女。

第37集
太后娘娘陳年老疾日益嚴重，此時又聽信崔尚宮的讒言，不願意接受申主簿的治療，並且不假辭色斥責中宗退出太后殿。中宗與皇后為此煩憂不已，並且決定先罷除申主簿醫官之職，以求太后息怒。如果太后還是不肯接受治療，中宗甚至準備再設朝歌屬恢復功臣田，只求太后娘娘接受治療。長今眼看申主簿即將被撤銷官職，不顧性命危險，希望與太后娘娘對弈，以自己的性命作為賭注。出了道無論是猜得出還是猜不出太后都會輸的謎題。太后對於長今的膽識與機智甚為懾服，決定給長今一次機會。但是當太后決定接受治療時，卻已錯過最佳治療時機，深受病痛之苦，連湯藥都無法喝下，不但驚動宮廷，甚至中宗也聞風趕到太后殿。長今研究出太后平時愛吃的食物都是對胃腸無益的，於是私下偷偷用大蒜做成藥丸餵太后吃下，太后竟全然吃不出大蒜的味道。後來被阿烈醫女發現告知內醫正大人，就在長今被責備時，太后得知長今用絕妙的方法掩蓋了自己最討厭的大蒜味道，嘆服長今的才智而使長今逃過一劫。

第38集
皇后懷念過去長今所做的蕎麥年糕的美味，請長今再度展現手藝，長今滿懷興奮誠心準備。皇后娘娘吃到美味的蕎麥年糕，心滿意足稱讚有加，今英看在眼裡懷恨在心，因此吩咐阿烈必須要想法子將長今趕出宮外。 此時，傳來京城附近爆發疫病，中宗甚為震驚，派監賑御使以及醫官和醫女等人到疫區為百姓治病。長今被阿烈陷害被派至疫區，當疫區病情無法控制時，京城下令要求封鎖整個村子，阿烈又故意不告知長今，將長今與疫區村民一起封鎖在村子裡面，無法離開，長今萬念俱灰。未料閔政浩發現長今沒有及時到達集合地點，毅然違抗旨意衝進村子尋找長今。

第39集
長今一個人被留在封鎖的村莊裡面。而當長今知道自己是被刻意遺棄在疫區，長今失望傷心，難掩悲痛。閔政浩除了安慰長今，同時打算帶長今離開疫區，但卻遭到百姓們的惡意圍攻。不過村內的百姓有些人病痛；還有些人是照顧病患的一般村民，長今又怎么忍心丟棄這些人獨自離開？因此決心留在疫區照顧村民。 閔政浩快馬加鞭（百姓以長今的性命威脅）到各處去找尋藥材，並且將張德帶到疫區一起照顧疫區病患。長今發現菜園裡面的蔬菜都腐爛，而且擴及各地，與張德討論過後得到結論，百姓們並不是得了傳染疫病，而是因為吃下病變的蔬菜引發的食物中毒，因此立即回宮稟報這件事實。崔尚宮卻認為這只是長今與閔政浩搪塞延遲回宮的理由，並且決定親自嘗試食用腐爛的蔬菜，確認長今所言是否屬實。也正如長今所言，崔尚宮出現了所謂傳染疫病該有的症狀。

第40集
閔政浩與長今還是因為沒有在規定時間內到達集合地點受到處分。閔政浩被罷除官職，幸由張德拜託一位隱居的官員詳細寫了一封上疏給中宗，中宗才得知其中原委，立即召回閔政浩並且予以升遷，而長今也因閔政浩力保得以繼續留在內醫院。連生懷孕的訊息傳開，並被下牒紙冊封為四品淑媛娘娘，並由內醫院指定讓阿烈負責照顧連生，阿烈明知連生身體狀況不適，有風熱症狀，卻告知連生只是孕婦血虛症狀，讓連生吃下不該吃的食物，目的只是希望讓連生小產。幸好長今聽連生訴說自己的病狀，才再度替連生診脈，查出原因告知申主簿。